現代醫學研究指出，咖啡豆含有糖類、蛋白質、脂肪、菸鹼酸、鉀、粗纖維、水份等營養 成份。此外、咖啡還含有咖啡因、單寧酸、生物鹼等有益人體健康的成份。
咖啡對人體的健康效用咖啡是目前被人類使用最久卻又誤解最多的飲料，許多最新的研究報告顯示，在許多方面 ，咖啡因對人體並沒有過去想像中有健康的危害；反之，咖啡中一些的成份對於人體有很 多的保健功效，都慢慢科學家發現。目前，已知道咖啡的特殊成份對人體的生理反應如下》 :
(1)抗氧化的效果 (Antioxidation) 咖啡中含有豐富的咖啡因、咖啡酸、綠原酸等成份，可以有效抗威脅我們身體健康的自由基，而自由基是造成許多疾病（如心肌病變、動脈硬化、中風、肺氣腫、巴金森氏症）的 主因。自由基過多會使身體代謝受到影響，破壞細胞進而使得器官組織受影響。
(2)保護心臟血管的功能 (Cardiovascular Diseases Prevention) 咖啡含有高成份的多酚化合物，這一類化合物是強力的抗氧化劑，能延緩低密度脂蛋白的 氧化時間高達三倍，可以溶解血液凝塊及阻止血栓的形成；咖啡還可以增強血管收縮，避免血管擴強而頭痛。此外，少量的咖啡也可以增強心肌收縮能力，促進血液循環，達到預 防心血管疾病的作用。
(3)提神醒腦 (Mind Refreshment) 咖啡所含的咖啡因會刺激腦部的中樞神經系統，延長腦部清醒的時間，使思路清晰、敏銳 ，且注意力較為集中，可提高工作及學習的效率。提升腦力思考：根據美國加州大學醫學院最近的研究證實，在你要發表演說或面試前，喝下含咖啡因的飲料，有助於讓女人腦力思考變得更加靈活。該校教授Hyla Cass表示，由於咖啡因可加強大腦釋放多巴胺（Dopamine），因而除了能幫助注意力集中、促進思考邏輯能力與提高記憶力外，還可使人出現正面的積極性和活動力等效用，不過他亦強調這個效果並不能持續太久，至多一個小時，所以建議你不妨在有重要的會議或面試前半小時，來杯咖啡吧！
(4)抗憂鬱 (Anti-depression) 少量的咖啡可使人精神振奮，心情愉快，紓解憂鬱的現象。
(5)控制體重 (Weight Control) 咖啡因能提高人體消耗熱量的速率，一項研究現１００毫克的咖啡因（約１杯咖啡），可 加速脂肪分解，能使人體的新陳代謝率，增加百分之三至四，增加熱能的消耗，適量飲用，有減重效果。咖啡因會刺激食慾雖然咖啡因確實具有加速體內脂肪分解的效果，且以咖啡因為主成分的瘦身減肥也蔚之風行，但你可曾知道，平常會有愛亂吃東西的小毛病或是莫名的飢餓感，很有可能是因為體內的咖啡因在作祟喔！振興醫院營養師黃幸妮指出，由於咖啡因會影響體內的中樞神經系統，導致增加胃酸的分泌、刺激食慾，使人容易出現肚子餓或想要吃東西的念頭，且若服用高劑量的咖啡因時，還會導致焦慮、噁心、失眠等副作用。因此，愛美的減肥一族們，在想利用一杯含有咖啡因的飲料裹腹提神前，建議最好再三考慮。
(6)促進消化 (Boost Digestion) 咖啡因會刺激交感神經，提高胃液分泌，如果在飯後適量飲用，有助消化。
(7)利尿 (Diuretic Effects) 咖啡具利尿作用，可提高排尿量，因而使上廁所次數增加。
(8)改善便秘 (Anti-Constipation) 咖啡可刺激腸胃激素或蠕動激素，產生通便作用，可當快速通便劑。并可降低患腸癌或直腸癌的機率，因为咖啡含有天然抗氧化物。
(9)止痛 (Relieve Pain) 咖啡因做為一個藥品時，可以加強某些止痛劑的效果。（可減緩偏頭痛）減輕頭痛問題：每天不先喝杯咖啡就頭痛嗎？經過美國芝加哥Diamond Headache診所出爐的一份報告證實，咖啡因的確具有舒緩頭痛的效果。Seymour Diamond醫生表示，咖啡因之所以能夠產生止痛的效果，主要是跟它可以限制血液流量有關，尤其如果你頭痛病症的起因，是來自腦部血管擴張的話，咖啡因可發揮減輕疼痛感的效力。但值得留意的是，此項咖啡因療法並不適用於長期頭痛的患者身上，因為一旦攝取過量的咖啡因，超過150毫克╱天的含量，反而會相對加重頭疼的程度。
(10)增強身體敏捷度 (Enhance Body Reflection) 咖啡因也有助於在運動時，使運動閥值隆低，增加身體的敏捷度，使運動員締造較好的成績。
(11)降低得膽結石的機會 (Reduce Gall Stones) 最新來自哈佛大學公共衛生學院的一項研究指出，每天喝２－３杯咖啡者比起從不喝的人 ，平均得到膽結石的機會小了４０％。此外，咖啡所含的單寧酸，具有收斂性及止血、防臭的作用。
(12)幫助呼吸 (Help in Respiration) 聽起來有些怪異，不過美國紐約Nassau大學醫學中心醫學教授Marianne Frieri卻指出，有許多長期深受氣喘問題所困擾的患者，如果早上來杯咖啡或濃茶時，會有呼吸道比較順暢的感覺，而美國醫學單位研究發現，咖啡因帶有反過敏的物質，可以抑制體內的組織胺，並具有擴張血管的作用，因而能產生舒緩放鬆呼吸道的效果，讓人感覺到呼吸變順暢的現象，可是他們卻也不建議罹患有氣喘的病人，以仰賴飲用含咖啡因飲料的方式，來改善氣喘呼吸不順暢的問題。
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